По экспорту и связанным с ним услугам, работам планируют дать право отказываться от ставки НДС 0%

Возможность отказаться от нулевого НДС получат экспортеры товаров, а также налогоплательщики по следующим операциям в отношении экспортируемых товаров:
— международная перевозка;
— транспортно-экспедиционные услуги;
— услуги по предоставлению вагонов и контейнеров;
— перевалка и хранение в портах.
Есть еще ряд операций, но они касаются незначительного числа налогоплательщиков.
Для отказа от нулевой ставки нужно будет подать в инспекцию заявление не позднее 1-го числа квартала, с которого юрлицо планирует платить НДС по ставке 10 или 18%. Отказ возможен не менее чем на год. При этом отказаться от нулевой ставки по конкретной операции нельзя. Платить НДС придется по всем сделкам.
Отметим, благодаря этой поправке будут фактически легализованы счета-фактуры с предъявленным НДС по ставке 18% вместо 0%. Такой налог можно будет безопасно принимать к вычету, если процедура отказа соблюдена. Напомним, что сейчас по неправильным счетам-фактурам суды вычет не разрешают. Например, этот вывод можно найти в Постановлении АС Дальневосточного округа и Определении ВС РФ. ФНС поддерживает такой подход. Минфин занимает аналогичную позицию.
Депутаты приняли проект в третьем чтении. Предположительно, поправки вступят в силу с 2018 года.

Документ: Проект Федерального закона N 113663-7  (http://sozd.parlament.gov.ru/bill/113663-7)
Принят в третьем чтении 16 ноября 2017 года